這三篇發表於Nature雜誌的重量級研究均使用了由英國生物庫藥物蛋白質體學專案（UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP）產生的資料，由13家國際生物製藥公司合作英國生物庫產生了新的蛋白質體學資料。研究人員利用Olink Explore平台，在超過54,000名英國生物庫參與者樣本中測量了約3,000種蛋白標誌物。並在此史無前例的大規模人群隊列研究上結合基因組和蛋白質組分析，獲得了大量關於基因對影響蛋白質表達和表型結果的新資訊。這些發現展示了蛋白質體學在闡明生物機制、發現可操作的新生物標誌物以及加速藥物開發工作方面的巨大價值。
第一篇來自UKB-PPP聯盟的Benjamin B. Sun博士等人[1]的論文提供了首批詳細資料總結，同時結合GWAS的蛋白質體學分析、蛋白質定量性狀位點（pQTL）映射、橫斷面疾病關聯以及人口因素和生理功能的蛋白質組預測等資料。文中報導發現了14,000多個蛋白質表達水準相關的遺傳關聯，且其中81％為最新發現。該篇具有里程碑意義的論文中的新發現，清楚地表明瞭高通量蛋白質測量對於識別重要生物途徑及其對健康影響的重要性。
UKB 首席科學家－Naomi Allen 教授
『這個重大研究為生物醫學界提供了全新的研究途徑，是對於如何通過跨部門合作帶來遠超其各自部分總和結果的一個典範。所有這些蛋白組學資料，連同英國生物庫中50萬名志願者的現有基因組、生活方式和健康資料一起，將很快向全球真正的研究人員開放。我對研究人員利用這些資料，來識別可能改變我們對疾病發展方式的理解，以及發現潛在新型治療途徑感到興奮。』
第二篇由Ryan S. Dhindsa博士等人聯合發表的論文[2]，主要由來自國際製藥公司阿斯特捷利康 （AstraZeneca）的成員撰寫，文中使用了上述首篇旗艦論文中資料集，研究了罕見蛋白質編碼變異與蛋白質表達之間的遺傳關聯。研究結果揭示了罕見變異在血漿蛋白質水準改變和生物結果中的重要作用，進一步凸顯了大規模蛋白質體學研究對於實現此類發現的關鍵需求。
AstraZeneca聯盟－Ryan S Dhindsa 博士
『文中我們重點介紹了蛋白質編碼pQTL圖譜如何應對藥物發現和臨床流程挑戰的幾個實例。我們預計該資源將為蛋白質調控網路及其抑制可能增加標靶蛋白水準上游轉錄調控基因提供新見解，並為藥物安全評估和藥物再定位提供新契機。』
第三篇由G. H. Eldjarn博士等人[3]撰寫的文章中將冰島大規模人群隊列研究資料結果做了兩種技術比較，包括Olink蛋白組學平台和SomaScan（基於適配體的技術）。儘管兩種平台都識別了大量與蛋白水準相關的遺傳關聯，但基於Olink蛋白組學平台資料結果顯示，其與順式pQTL相關性具有顯著更高比例72%（與SomaScan適配體技術的43％相比），這為Olink平台具有更高特異性提供了強有力的遺傳證明。此外，Olink平台資料的中位數變異係數（median CV ratio）更低，表明其平均值更精確。
Olink 首席執行官－Jon Heimer
『Olink非常自豪地成為UKB-PPP倡議的蛋白質體學技術平台的獨家選擇，我們也很高興看到來自該出色合作團隊的首次發表成果。這些里程碑式的發表文章強有力地證明了下一代蛋白質體學如何揭示傳統基因組學無法看到的生物學關鍵。我們正在見證一個新的多組學時代，它將使我們對即時人類生物學的理解達到前所未有的高度，並推動21世紀醫療健康和藥物開發的新旅程。』
【參考文獻】
1. Sun et al. (2023) Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06592-6
2. Dhindsa et al. (2023) Rare variant associations with plasma protein levels in the UK Biobank. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06547-x
3. Eldjarnet al. (2023) Large-scale plasma proteomics comparisons through genetics and disease associations. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06563-x
資料來自 Olink 微信官方帳號，作者 Olink China
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