>

單細胞定序服務

為何要進行單細胞定序

組織的組成通常都是具高度異質性的,例如血液組織就包含了紅血球、顆粒性白血球、淋巴球、單核球、血小板….等多種細胞。傳統的定序服務是將大量細胞混合在一起,進行核酸萃取以及定序服務,因此看到的基因表達都是來自所有細胞的平均值,掩蓋了細胞異質性,甚至會遺漏了稀有細胞的資訊。而透過單細胞定序服務,則可以清楚知道每顆細胞的基因表現結果,揭露細胞異質性。

 

單細胞定序服務– 10x Genomics 技術

單細胞定序服務是透過10x Genomics公司研發的Chromium系統,進行單細胞標定,進而定序每顆細胞的DNA或RNA。Chromium 是液流控制系統,可完成自動化的液體流動和油滴包覆,目的為實現將單個GelBeads與單顆細胞包覆於油滴中。GelBeads也是10x Genomics技術核心,每個Gel Beads都帶有獨特的核苷酸分子條碼,可用於單顆細胞的標定。

 

服務流程

更多技術資訊請至10x Genomics網站

 

服務內容

Single Cell RNA-Seq

  • 一次可捕獲100-10,000顆細胞,偵測其單細胞內基因表現
  • 揭示細胞異質性,可應用於腫瘤微環境、胚胎發育、神經退化疾病....等研究
  • 定序深度建議: > 20,000 reads/cell
  • 適合樣本種類: 新鮮細胞懸浮液、PBMC、細胞株

Sample Multiplexing

  • 可進行12-plex 混樣大幅降低單一樣本實驗成本
  • 採用特殊細胞標定技術,不受物種限制
  • 細胞或細胞核皆可適用
  • 搭配10x Feature Barcode功能,可在同一顆細胞觀察到RNA與表面蛋白表現,增加細胞分群解析度
  • 僅限於搭配3’single cell RNA-Seq服務

Single Cell Immune Profiling

  • 一次實驗可同時進行單細胞RNA-Seq與免疫細胞型別多樣性(immune repertoire) 研究。
  • 提供人類與老鼠的TCR / BCR 高通量檢測方案。
  • 可用於探索腫瘤微環境,自體免疫疾病發病機制探討、臨床移植後追蹤等應用。
  • 定序深度建議:V(D)J Library – 5,000 reads/cell, 5’ RNA Library - 20,000 - 50,000 reads/cell
  • 樣本種類:新鮮人或老鼠細胞懸浮液、PBMC