單細胞定序服務
為何要進行單細胞定序
組織的組成通常都是具高度異質性的，例如血液組織就包含了紅血球、顆粒性白血球、淋巴球、單核球、血小板….等多種細胞。傳統的定序服務是將大量細胞混合在一起，進行核酸萃取以及定序服務，因此看到的基因表達都是來自所有細胞的平均值，掩蓋了細胞異質性，甚至會遺漏了稀有細胞的資訊。而透過單細胞定序服務，則可以清楚知道每顆細胞的基因表現結果，揭露細胞異質性。
單細胞定序服務– 10x Genomics 技術
單細胞定序服務是透過10x Genomics公司研發的Chromium系統，進行單細胞標定，進而定序每顆細胞的DNA或RNA。Chromium 是液流控制系統，可完成自動化的液體流動和油滴包覆，目的為實現將單個GelBeads與單顆細胞包覆於油滴中。GelBeads也是10x Genomics技術核心，每個Gel Beads都帶有獨特的核苷酸分子條碼，可用於單顆細胞的標定。
服務流程
更多技術資訊請至10x Genomics網站
服務項目
Single Cell RNA-Seq
- 一次可捕獲100-10,000顆細胞，偵測其單細胞內基因表現
- 揭示細胞異質性，可應用於腫瘤微環境、胚胎發育、神經退化疾病....等研究
- 定序深度建議: > 20,000 reads/cell
- 適合樣本種類: 新鮮細胞懸浮液、PBMC、細胞株
Sample Multiplexing
- 可進行12-plex 混樣大幅降低單一樣本實驗成本
- 採用特殊細胞標定技術，不受物種限制
- 細胞或細胞核皆可適用
- 搭配10x Feature Barcode功能，可在同一顆細胞觀察到RNA與表面蛋白表現，增加細胞分群解析度
- 僅限於搭配3’single cell RNA-Seq服務
Single Cell Immune Profiling
- 一次實驗可同時進行單細胞RNA-Seq與免疫細胞型別多樣性(immune repertoire) 研究。
- 提供人類與老鼠的TCR / BCR 高通量檢測方案。
- 可用於探索腫瘤微環境，自體免疫疾病發病機制探討、臨床移植後追蹤等應用。
- 定序深度建議：V(D)J Library – 5,000 reads/cell, 5’ RNA Library - 20,000 - 50,000 reads/cell
- 樣本種類：新鮮人或老鼠細胞懸浮液、PBMC