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高通量定序網路研討會:細菌組裝與總體基因體學解決方案

網路研討會 Online

主題:細菌組裝與總體基因體學解決方案
     The Best Solution for Bacterial de novo Assembly and Metagenomics

日期:2020 年 8 月 28 日   (星期五)

時間:15:00 – 16:00

講者:生物資訊部 陳冠群

主辦單位:基龍米克斯

 

PacBio HiFi Reads為兼顧長讀長 (>10kb) 和高準確度 (>99%) 的定序數據,透過HiFi Reads可以對基因組進行全面的分析,包括全基因組組裝 (de novo Assembly)、結構變異檢測 (Structural variation detection) 和SNP檢測,應用範圍廣泛。
使用PacBio SMRT Sequencing執行細菌全基因體組裝已為黃金標準,可輕鬆獲得1 Genome = 1 Contig 高完整度與高品質之組裝結果,用於研究細菌抗藥性、毒力或代謝機制皆有極佳效果。
總體基因體學 (Metagenomics) 則為近來熱門主題,使用PacBio Shotgun Metagenomics能夠保留樣品最全面的訊息,HiFi reads在鑑定複雜微生物菌相及探討基因註釋與功能性分析,因其長讀長與高準確度之特性而具有極大的優勢,在達到基因體組裝的深度需求時,還能獲得完整的微生物全基因體資訊。

 

本次研討會將獲得以下資訊

  • PacBio SMRT定序原理與其優勢

  • 定序數據處理流程

  • 如何執行細菌全基因體組裝 (Bacterial de novo Assembly)

  • 如何執行總體基因體學之分析 (Shotgun Metagenomics Sequencing)

 

報名連結

https://www.surveycake.com/s/4wKX0

 

注意事項

  • 報名截止日: 2020 年 8 月 26 日 17:00 止
  • 請於網路報名時填寫正確可用之 E-mail,活動前一天(8/27)會由主辦單位將「網路研討會連結」以 E-mail 方式告知。